На 1-м этаже — прекрасная парадная лестница, используемая под различные торжественные и культурные мероприятия.
На 2-м этаже вдоль Дворцовой площади развернута постоянная экспозиция «Искусство модерна». На ней можно увидеть вещи, выполненные западноевропейскими и русскими мастерами в конце XIX — начале XX столетия: костюмы, кружева, изделия из фарфора, керамики и стекла. 
В соседних помещениях бывшего министерского корпуса Главного штаба размещена экспозиция, посвященная Истории Министерства финансов. Именно здесь с 1830 по 1918 год находилось Министерство финансов Российской империи, Временного Правительства и РСФСР. В комплекс министерских помещений входили: Кабинет министра финансов с Приемной, Библиотека и комната Кредитной канцелярии.
На 3-м этаже Главного штаба, выходящих на набережную реки Мойки, показана часть экспозиции музея Российской Гвардии – «Российская гвардия XVIII века». Посетители смогут увидеть предметы обмундирования и вооружения, боевые знамена и штандарты, а также дары – драгоценные реликвии, сохраненные потомками российских офицеров и вернувшиеся в Россию после долгого пребывания за ее пределами.
Рядом располагается постоянная выставка «Министерство Иностранных Дел России. Петербургский век 1802-1917», посвященная истории российского МИДа со дня его основания императором Александром I до 1917 года, где представлены живописные и графические произведения, фотографии, исторические реликвии, предметы декоративно-прикладного искусства.
На больших экспозиционных пространствах (Дворцовая и Певческая линии) Эрмитаж возрождает масштабную экспозицию «Под знаком орла. Искусство ампира». Художественный облик залов, созданных великим русским зодчим первой четверти XIX века К.И. Росси и расписанных П. И. Скотти, дает возможность показать в историческом контексте мебель, шпалеры, бронзу, серебро, костюмы, демонстрируя грандиозный размах художественного творчества периода Империи и взаимовлияние различных европейских культур, развитие которых несмотря на исторические перипетии, шло в одном направлении.
Залы памяти Карла Фаберже – одна из интереснейших частей нового музейного комплекса. Здесь представлено наследие фирмы, основанной знаменитым Карлом Фаберже, показано дальнейшее развитие и достижения современного ювелирного и камнерезного искусства. 
Ряд больших залов третьего этажа посвящен русской живописи XIX – начала XX столетия. Работы художников, среди которых произведения кисти К.П. Брюллова, А.А. Иванова, В.А. Тропинина, К.С. Петрова-Водкина, Б.М. Кустодиева, И.Н. Крамского, В.Е. Маковского позволяют проследить развитие русской школы живописи. 
На 4-м этаже открывается Галерея памяти Сергея Щукина и братьев Морозовых, где представлены произведения импрессионистов и постимпрессионистов, ранее находившиеся на третьем этаже Зимнего дворца. Уникальность новой экспозиции в том, что впервые собрание французской живописи XIX–XX веков Эрмитажа показано целостно, без разделения произведений по принципу поступления. Открывает галерею зал Клода Моне с четырнадцатью картинами мастера, линию импрессионизма продолжают зал Эдгара Дега с его «Площадью Согласия», комната натюрмортов Анри Фантен-Латура, зал пейзажей Камиля Писсарро и Альфреда Сислея. В двух следующих залах разместилось редкое по богатству собрание работ Огюста Ренуара. Далее представлены произведения Поля Сезанна, Винсента ван Гога, Поля Гогена, замыкают галерею залы художников группы «Наби». Спустя 10 лет вновь вернулись в Главный штаб полотна Пьера Боннара, Эдуарда Вюйара, Мориса Дени. Картины Анри Матисса переехали в залы Главного Штаба еще летом, сделавшись частью европейской биеннале «Манифеста 10».